数个专业团体和一个美国肝病学家团体（得到一家制药公司无限制性资金支持）发表了关于慢性HBV感染病人的抗病毒治疗建议。这些建议中权威性和影响力最大、最新的是美国肝病研究学会的实用指南。

对于HBeAg反应性慢性HBV感染，抗病毒治疗的适应证是ALT水平>正常上限的2倍，HBV-DNA>20,000IU/ml的病人；ALT水平升高的病人其HBeAg、生化和组织学应答更有可能持久。如不给予病人抗病毒治疗，随访1年期间大约1/4病人的纤维化进展。治疗的适应证非常明确，不一定要做治疗前肝活检，有黄疸或肝脏失代偿其他证据的病人应紧急开始治疗。对于HBV-DNA水平>20,000IU/ml，但ALT水平≤正常上限2倍的HBeAg阳性病人（在围产期获得性感染的年轻亚洲人中常见），疾病在最初数十年进展有限，此时HBV-DNA水平高，伴随生化静止，基线组织学分级和分期往往较低，ALT水平已正常或接近正常。虽然关于此类病人的治疗存在争议，但此类病人获得生化应答和HBeAg血清学应答的机会很小，给予他们抗病毒治疗很少能获得任何近期的临床好处；临床监测足以及时发现活动性肝病的出现，并给予相应的治疗。因此，不建议常规给这些病人抗病毒治疗，除非他们有进展的危险因素【即>40岁，有肝细胞癌家族史，ALT水平>正常范围（最高可达正常上限的2倍）】。在这些情况下，应考虑肝活检，应开始治疗中度－重度的坏死性炎症或纤维化。

ALT水平>正常上限2倍，HBV-DNA水平>20,000IU/ml的HBeAg阴性的慢性HBV感染病人有抗病毒治疗适应证，病人不一定选择做肝活检。如果ALT水平持久≤正常上限的1～2倍，HBV-DNA水平>2,000IU/ml，不会常规建议给予病人抗病毒治疗；应考虑肝活检，中度－重度坏死性炎症或纤维化应做治疗。非活动性HBV携带者（即ALT水平持久正常，HBV-DNA水平≤2,000IU/ml者）无抗病毒治疗适应证。转变至此状态是多数治疗成功病人达到的临床终点。然而，与其他慢性HBV感染病人一样，非活动性HBV携带者可能在停用免疫抑制治疗过程中出现严重的HBV重激活。因此，建议在开始免疫抑制治疗或细胞毒化疗前先给1个核苷或核苷类似物治疗。